Las  actividades comerciales de mayor relevancia en la Parroquia Alajuela son: La compra de productos agrícolas como el café, cacao, yuca, tagua, maíz, maní, naranja, limón. Estos productos provienen de las diversas comunidades de la Parroquia y son vendidos en la cabecera parroquial, en los sitios La Madera, El Jobo, en la Parroquia Calderón, o en los cantones Portoviejo y Manta. 

En cuanto a la comercialización de la producción pecuaria, los comerciantes intermediarios minoristas acuden a las comunidades para la compra directa de los animales menores, predominando las gallinas y los cerdos. En cuanto a la venta de legumbres y verduras en el mercado local, la realiza el señor: Franklin Ponce labor que solo se realiza los días viernes y domingo.

En la parroquia Alajuela existe un pequeño mercado, el cual tiene mayor afluencia los fines de semana, el feriado comercial prácticamente es muy poco, y en  los días de semana lunes a viernes, se observan pequeños comercios como una tienda, una sastrería y un comedor prácticamente sin compradores, los mesones para pesar carne están vacíos, esto evidencia la pérdida del flujo comercial en la parroquia.